Apple iPhone 16 Plus dispune de o baterie de 4674 mAh, cu 300 mAh mai mult decât modelul anterior, iPhone 15 Plus. Viteza de încărcare MagSafe a crescut de la 15W la 25W, iar telefonul poate funcționa ca power bank, alimentând alte dispozitive prin USB-C la 4.5W. În teste, autonomia a atins 31 de ore și 9 minute, plasându-l pe locul 2 în topul telefoanelor testate, depășind modele Galaxy S24 și iPhone 16 Pro Max. Bateria se încarcă la 59% în 30 de minute, dar durează 1 oră și 34 de minute pentru a ajunge la 100%.