Alexandru Rafila a semnalat o problemă gravă în sistemul de sănătate din România prin faptul că multe direcții de sănătate publică nu mai sunt conduse de medici, ci de economiști și ingineri. El a evidențiat că diferențele salariale între funcționarii publici și medicii din subordine contribuie la această situație. De asemenea, ministrul a criticat gestionarea ineficientă a cazurilor de meningită bacteriană în Maramureș, unde toate unitățile de învățământ au fost închise. Rafila a propus crearea unei rețele mai eficiente a Institutului Național de Sănătate Publică pentru a îmbunătăți coordonarea în gestionarea problemelor de sănătate publică, subliniind importanța unui corp tehnic competent în acest domeniu.