Avengers: Secret Wars va marca o transformare semnificativă pentru Universul Cinematic Marvel (MCU), conform declarațiilor lui Kevin Feige. Acesta a subliniat că povestea va conduce la o nouă eră a mutanților și a X-Men-ilor, sugerând că aceștia au existat în universul Marvel de mult timp. Teoriile sugerează că Scarlet Witch ar putea avea gene mutante și ar putea ajuta la înfrângerea lui Doctor Doom, creând o nouă realitate favorabilă mutanților. Această evoluție va schimba radical MCU, lăsând întrebări despre viitorul supereroilor clasici precum Captain America și introducerea unor noi povești pentru personaje iconice precum Wolverine și Rogue.